Data Engineer (m/w/d) - #28665

Die iiT Research & Development GmbH ist im Bereich der internationalen Krebsforschung tätig. Wir suchen derzeit eine organisierte, proaktive und hochqualifizierte Persönlichkeit als Data Engineer zur Verstärkung unseres Teams in Salzburg.

Ihre Rolle

Als Data Engineer konzipieren und skalieren Sie ein leistungsstarkes Ökosystem für Gesundheitsdaten. Sie schließen die Lücke zwischen komplexen technischen Datenpipelines und strengen Qualitätsmanagementsystemen (QMS), wie der DIN ISO 13485. Ihre Arbeit stellt sicher, dass integrierte klinische Metadaten und biologische Multi-Omics-Daten (z. B. Transkriptomik und Genomik) automatisiert, reproduzierbar und vollständig konform mit EU-Vorschriften (MDR, IVDR und DSGVO) bleiben.

Ihre Aufgabenbereiche

1. Datenerfassung & klinisches Management

• Multi-Modale Integration: Kuratierung integrierter Datensätze, die klinische Metadaten mit biologischen (GEO, TCGA, ArrayExpress) und Labordaten kombinieren.
• Automatisierte Suche: Aufbau automatisierter Systeme für den keyword-basierten Abruf und die Integration von Datensätzen aus öffentlichen Repositories.
• Interoperabilitätsstandards: Harmonisierung heterogener Daten unter Verwendung von HL7 FHIR, DICOM und SNOMED CT, um eine nahtlose klinische Integration zu gewährleisten.

2. Automatisierte Pipelines & Orchestrierung

• End-to-End ETL/ELT: Design skalierbarer Pipelines für die Datenaufnahme, Normalisierung und Handhabung fehlender oder inkonsistenter Daten.
• Workflow-Orchestrierung: Einsatz von Apache Airflow zur Verwaltung komplexer Vorverarbeitungspfade, einschließlich Imputation und Qualitätskontrolle.
• Rückverfolgbarkeit: Führung strenger Dokumentationen, Versionierungen und Audit-Trails, um 100 % Reproduzierbarkeit und Audit-Bereitschaft für Benannte Stellen (Notified Bodies) zu garantieren.

3. Datenarchitektur & fortgeschrittene Integration

• Domänen-Harmonisierung: Standardisierung von Identifikatoren und Ontologien über verschiedene klinische Aufzeichnungen und biologische Daten hinweg.
• Infrastruktur-Exzellenz: Design und Wartung von Data Lakes und Warehouses, die für Machine Learning, NLP und klinische Entscheidungsunterstützung optimiert sind.

4. Governance, Sicherheit & Compliance

• Regulatorische Konformität: Sicherstellung, dass die gesamte Infrastruktur der EU MDR (2017/745) und IVDR (2017/746) sowie der DIN ISO 13485 entspricht.
• Datenschutz: Implementierung granularer Zugriffskontrollen, Datenschutz-Folgenabschätzungen (DPIA) und ethischer KI-Frameworks zum Schutz sensibler Patienteninformationen.

Ihr Profil

• Ausbildung: BSc/MSc in Bioinformatik, Informatik, Data Science oder einem verwandten naturwissenschaftlich-technischen Bereich.
• Erfahrung: 3–5+ Jahre Erfahrung im Data Engineering in regulierten Sektoren (Medizintechnik, Gesundheitswesen oder Life Sciences).
• Technical Stack: * Exzellente Kenntnisse in Python (inkl. ML Frameworks) und SQL.
  • Praktische Erfahrung mit Docker, Apache Airflow und Cloud-Plattformen (AWS, Azure oder GCP).
• Fachwissen: Tiefes Verständnis biologischer Datenformate und klinischer Standards (FHIR, SNOMED).
• Regulatorik: Vertrautheit mit DSGVO, MDSAP und der technischen Dokumentation für Medizinprodukt-Software.

Was wir bieten

• Finanzielle Sicherheit: € 77.000 Bruttomonatsgehalt mit möglicherÜberzahlung je nach Qualifikation und Erfahrung.
• Sinnstiftende Arbeit: Eine Expertenrolle (Subject Matter Expert), die direkt die KI-gestützte Patientenversorgung und die klinische Forschung beeinflusst
• Kollegiale Kultur: Arbeit in einem multidisziplinären Team zusammen mit führenden Partnern aus Wissenschaft und Industrie.
• Nachhaltige Mobilität: Sie erhalten für Ihren Arbeitsweg das Klimaticket Salzburg.